V této ambulanci jsou léčeni a dlouhodobě sledováni pacienti s onemocněním zažívacího traktu, tj. žaludku, tenkého střeva, tlustého střeva a konečníku, dále také s onemocněním jater a slinivky břišní a jícnu.
Kromě běžných vyšetřovacích metod jsou poskytována specializovaná endoskopická vyšetření (gastrofibroskopie a kolonoskopie), dále ultrazvuková vyšetření břicha a orgánů dutiny břišní.